摘要： 当今国际科技竞争本质上是创新体系的竞争。创新体系是“母”，科技产品是“子”。本文直面我国创新体系效能研究中存在的重“效”轻“能”问题，提出“创新体系效能”要“效”与“能”并重。“效”，是将创新体系看作“黑箱”，分析创新投入产出绩效；“能”，将创新体系看作“白箱”，考虑内部运作结构，“科学-技术-产业”各环节间的协同度、开放度、深度、广度、速度等。“效”与“能”结合，是基于结果导向和过程导向的全面评价，能满足深层管理决策需要。构建“科学-技术-产业”理论分析框架；提炼创新体系的结构特征及协同模式；兼顾“效”与“能”，从创新绩效、创新协同度、创新开放度、创新深度、创新广度、创新速度等方面剖析提升创新体系效能的机制，探讨体系结构、协同模式与产出绩效之间的关系，提出提升创新体系效能，要增强创新主体之间的“协同性”；促进增强创新的广度与深度；依据体系结构、协同模式与产出绩效之间的对应关系，探索不同产业情境下的最佳创新路径。从而为学研机构、企业、政府等精准施策和科学决策提供理论指导。